До этого на его месте последовательно существовали две деревянные церкви, уничтоженные пожарами.Третья деревянная церковь, разобранная в 1794 году, предположительно находилась на месте нынешнего каменного храма.
Архитектурно храм представляет собой восьмерик на четверике, одноглавый, бесстолпный, с тремя алтарными апсидами и четырехъярусной колокольней. Трапезная соединяет четверик и колокольню. В интерьере сохранились фрагменты росписей конца XVIII — начала XIX века, включая изображения евангелистов на парусах и отдельные сюжеты из Евангелия. Иконостас не сохранился.
До середины 1950-х годов приход храма включал девять населенных пунктов: село Пречистое и деревни Покров, Заозерье, Яковково, Буково, Старово, Кильгино, Любильцево, Итларь. После изменения границ Ростовского района к числу приходских селений добавились деревни Остеево и Конюково.
В 1962 году в селе Пречистое киностудией имени Горького проводились съемки атеистической комедии «Конец света». После этого началось разграбление и разрушение храма. Здание оставалось в запустении до 2009 года, когда были инициированы ремонтно-восстановительные работы. В октябре 2011 года в храм был назначен настоятель, что способствовало возрождению приходской жизни.