Проект разработал архитектор Александр Александрович Щербачёв, и он был утверждён в Санкт-Петербурге в 1906 году.В составе комплекса предусматривалось устройство домовой церкви, которая была освящена во имя святителя Иоанна Златоуста.
В 1918 году, после закрытия семинарии советскими властями, здание использовалось для различных целей, включая размещение средней школы № 29 и Дворца пионеров Октябрьского района.
В 1992 году здание было возвращено Самарской епархии. В 1993 году в нём был открыт храм в честь преподобных Кирилла и Марии Радонежских, родителей преподобного Сергия Радонежского. Росписи в храме выполнил художник Виктор Вартанович Чемирзов совместно с группой иконописцев под руководством игумена Мануила (Литвинко), руководителя иконописных мастерских Троице-Сергиевой лавры.