Храм преподобного Агапита Маркушевского в селе Нюксеница Вологодской области представляет собой деревянную церковь, построенную в традициях северного русского зодчества. Строительство храма началось в 2001 году и завершилось в 2008 году. Храм возведен на средства благотворителей и прихожан. Архитектурное решение включает шатровый основной объем и шатровую колокольню, что характерно для храмового строительства Русского Севера.
Преподобный Агапит Маркушевский, в честь которого освящен храм, является местночтимым святым Вологодской земли. Он основал Маркушевский Николаевский монастырь в XVI веке, расположенный недалеко от Нюксеницы. Храм в Нюксенице стал преемником духовной традиции, связанной с памятью этого подвижника.
Церковь построена из дерева с использованием традиционных плотницких технологий. В архитектуре прослеживаются элементы, характерные для вологодской школы деревянного зодчества: восьмерик на четверике, тесовая кровля, лемеховое покрытие глав. Алтарная часть храма завершается бочкой с малой главкой, что является отличительной особенностью северных храмов.
Приход храма был официально зарегистрирован в 2002 году, хотя религиозная община существовала с 1999 года. Храм относится к Великоустюжской епархии Русской Православной Церкви. За время существования храм не подвергался значительным перестройкам и сохранил первоначальный архитектурный облик.
В храме находится один престол, освященный в честь преподобного Агапита Маркушевского. Богослужебная жизнь прихода соответствует уставу Русской Православной Церкви. Храм остается действующим и является центром духовной жизни села Нюксеница и окрестных поселений.