Здание храма Пресвятой Троицы в Балтиморе было построено в 1866–1869 годах для методистской общины. Архитектором проекта выступил Джон Хогг. В 1892 году здание перешло в собственность немецкой лютеранской общины, которая владела им до 1919 года. В феврале 1919 года храм был приобретён группой русских эмигрантов, преимущественно выходцев из западных губерний Российской империи, включая территории современной Белоруссии, Украины и Польши.
9 февраля 1919 года инициативная группа провела собрание, на котором было принято решение об организации православного прихода. Первоначально богослужения проводились в арендованных помещениях, а с марта 1919 года община начала выкуп здания. 18 марта 1919 года приход был официально зарегистрирован в штате Мэриленд как Свято-Троицкая Русская Православная Независимая Церковь. Название отражало как принадлежность к русской православной традиции, так и независимый статус прихода в вопросах управления имуществом.
В 1920-х годах приход столкнулся с финансовыми трудностями, связанными с неправильным администрированием, но к 1922 году новый избранный комитет смог погасить задолженность. В 1931 году храм был освящён епископом Феодосием (Самойловичем) из Детройта. В 1930-е годы численность прихожан сократилась из-за миграции русской общины в пригороды, однако позднее приход пополнился за счёт иммигрантов из стран бывшего СССР.
В 1949 году интерьер храма был оформлен в соответствии с православными канонами, включая иконы и фрески. В 1980-х годах проведена масштабная реконструкция здания. С 2002 года в доме причта размещается женский Свято-Троицкий монастырь, связанный с монастырём Святой Марии Египетской в Нью-Йорке.
Приходское кладбище было основано в 1926 году в графстве Анна Арундел, но в 1947 году перенесено в графство Ховард из-за строительства аэропорта. На кладбище сохранилась часовня Святых Петра и Павла, построенная в 1939 году. В 2001 году при часовне открыт русский миссионерский филиал для обслуживания русскоязычных верующих.