Церковь Преображения Господня в селе Юматово построена не позже 1823 года на средства помещицы Екатерины Петровны Геркен, представительницы рода, владевшего этими землями с конца XVIII века. Первый приход в селе существовал с 1752 года, когда здесь действовала деревянная Покровская церковь. Каменный двухэтажный храм возведен в стиле классицизма с тосканскими портиками на фасадах. Главный престол на втором этаже освящен в честь Преображения Господня, теплые приделы — в честь иконы Божией Матери «Живоносный Источник» и святого Петра, митрополита Московского.
В 1830 году Петр Федорович Геркен и его мать Екатерина Петровна инициировали перестройку храма. В 1882 году майор Владимир Федорович Геркен надстроил четвертый ярус колокольни. Храмовая территория включала фамильное захоронение Геркенов-Боратынских, расположенное с восточной стороны. Надгробия сохранились частично; некоторые были перенесены на местное кладбище в XX веке.
В советский период, после 1930-х годов, здание использовалось как тракторная мастерская, затем как склад. Внутреннее убранство, включая фресковую живопись, значительно пострадало. Сохранились элементы росписей под сводами и в алтарной части. В 2010-х годах начались восстановительные работы силами местных жителей и прихожан. Временный иконостас и алтарь были установлены к 2018 году.
Архитектурный комплекс включает основной объем, трехъярусную колокольню (с четвертым ярусом, добавленным в 1882 году) и апсиду. Планировка храма предполагала размещение основных залов на втором этаже, с печным отоплением на первом. Приходская жизнь возобновилась в ходе реставрации, хотя постоянного духовенства в селе не было. Исторически приход обслуживался священниками из соседних сел, включая выпускника Казанской духовной академии Ивана Петровича Паленина, служившего здесь в 1835–1839 и 1873–1891 годах.