В 1992 году для организации православного прихода в Южноуральске было передано здание бывшего автовокзала, которое после реконструкции стало использоваться как храм. Первое освящение храма провёл епископ Георгий. В 1993 году здание было вновь перестроено по проекту челябинских инженеров В. Першина и В. Чебураева. Иконостас был спроектирован мастерами из Палеха, а выполнен мастером А. Нестеровым из Южноуральска. Колокола храма изготовлены в Каменск-Уральске.
В марте 2000 года храму была передана местными жителями старинная и местночтимая икона Архангела Михаила, написанная в память ухода казаков Оренбургского казачьего войска на войну в июле 1914 года.
В настоящее время храм Преображения Господня продолжает свою деятельность, являясь центром духовной жизни для жителей Южноуральска и окрестностей. В нём регулярно проводятся богослужения, способствующие укреплению православных традиций в регионе.