Деревня Напольные Котяки имеет глубокие исторические корни, восходящие к XVI веку. Первые упоминания о поселении связаны с переселением жителей из деревни Катек (ныне Тупнер) Цивильского района. С течением времени деревня развивалась, и к началу XX века здесь функционировали кузница, две водяные мельницы и две круподёрки.
В советский период религиозная жизнь в деревне, как и во многих других населённых пунктах страны, претерпела значительные изменения. Храмы закрывались, а религиозная деятельность ограничивалась. Однако с началом перестройки и последующим ослаблением государственного контроля над религией начался процесс возрождения духовной жизни.
В 1995 году в деревне Напольные Котяки был построен каменный храм в честь Покрова Пресвятой Богородицы. Строительство осуществлялось на средства уроженца села, предпринимателя Н. Г. Григорьева. Храм был возведён в соответствии с традициями русского православного зодчества, с использованием современных строительных материалов и технологий.
Архитектурно храм представляет собой двупрестольное сооружение. Главный престол освящён в честь Покрова Пресвятой Богородицы, а придельный — в честь святителя Николая Мирликийского Чудотворца. На территории храма также расположена часовня, посвящённая великомученику Георгию Победоносцу. Здесь регулярно проводятся богослужения, церковные праздники и обряды. Храм также служит местом проведения религиозного образования и воспитания подрастающего поколения.
В настоящее время храм Покрова Пресвятой Богородицы в деревне Напольные Котяки является действующим и входит в состав Чебоксарской и Чувашской епархии Русской Православной Церкви.