Первое упоминание о Покровском храме в селе Морозовы Борки встречается в окладных книгах 1676 года. В тот период церковь находилась под попечительством боярина Бориса Ивановича Морозова. Деревянный храм имел придел в честь Архангела Михаила и был разобран в XVIII веке по причине ветхости.
В 1758 году на месте прежнего храма была возведена новая деревянная церковь с тем же посвящением Покрову Пресвятой Богородицы. Здание просуществовало до 1805 года, когда полностью сгорело при пожаре. В августе того же года началось строительство каменного храма по инициативе управителя имения графа Дмитрия Зубова.
Строительство велось на средства графа Дмитрия Андреевича Зубова, майора Петра Григорьевича Щепочкина и помещика Николая Максимовича Савина. Основные работы завершились к 1808 году, но окончательное освящение состоялось лишь в 1817 году из-за событий Отечественной войны 1812 года. Храм был построен в стиле классицизма с ротондой и трехъярусной колокольней.
В храме устроено три престола: главный - в честь Покрова Богородицы, правый - во имя святых апостолов Петра и Павла, левый - в честь святителя Димитрия Ростовского. Иконостас выполнен мастером Иваном Люхиным из села Ижевска с применением резных позолоченных колонн. Настенные росписи включали изображения святых в полный рост, включая Василия Рязанского и Иоанна Богослова.
В 1937 году после кончины последнего дореволюционного настоятеля протоиерея Иоанна Солидова храм был закрыт. В 1940 году началось его разрушение - были сброшены колокола, уничтожены иконы. В здании размещался склад сельпо. Попытки полного сноса в 1962 и последующие годы были предотвращены местными жителями.
Богослужебная жизнь возобновилась в апреле 1990 года с пасхального богослужения. В 1991 году на храм установили новые кресты, в 1993 - колокола. Проведены работы по восстановлению отопления, внутренней отделки, созданию нового иконостаса. В 2007 году в переданном здании бывшей пожарной части открыта православная библиотека и воскресная школа.
