Здание храма ранее использовалось как складское помещение и было выкуплено жителями посёлка для организации церковных служб.
Посёлок Коммаяк был основан в августе 1920 года на месте бывшего поместья Карпушина, где была образована первая на Ставрополье коммуна «Первая Незлобненская», с 1921 года переименованная в «Коммаяк». Впоследствии на её месте возник посёлок с одноимённым названием.
В 1934 году в посёлке был создан колхоз «Коммунистический маяк», ныне преобразованный в акционерное общество «Коммаяк».
В период с 7 по 10 января 1943 года посёлок Коммаяк был освобождён от немецко-фашистских захватчиков силами 36-й танковой дивизии и 5-го Донского казачьего корпуса.
До 1 мая 2017 года посёлок являлся административным центром упразднённого Новосредненского сельсовета.