Храм Покрова Пресвятой Богородицы в городе Белореченске ведет свою историю с 1863 года, когда в станице Белореченской был построен молитвенный дом, освященный в честь Покрова Пресвятой Богородицы. В 1881 году на средства Кубанского казачьего войска с участием прихожан была возведена деревянная Покровская церковь на каменном фундаменте, освященная 20 сентября того же года. Храм располагался на территории современного парка Победы.
В середине 1930-х годов Покровская церковь была разрушена. Возрождение прихода произошло в 1996 году, когда городские власти передали верующим здание по улице Шалимова, 1. Это строение, возведенное в 1907 году, первоначально использовалось как синематограф, в период немецкой оккупации в нем размещалось гестапо, а в послевоенные годы - различные учреждения, включая детский кинотеатр.
После передачи здания приходу оно было переоборудовано для богослужений. Первая литургия состоялась в 1997 году на праздник Николы Вешнего. Первоначально храм рассматривался как временное решение, однако планы восстановления церкви на историческом месте не были реализованы. В начале 2000-х годов храм был освящен архиерейским чином, а в последующие годы полностью реконструирован.
Архитектурно здание храма представляет собой адаптированное под церковные нужды строение начала XX века. Исторические источники указывают на существование в станице Белореченской двух храмов: Покровской церкви (1882) и Успенской единоверческой церкви (1892). Современный храм продолжает традиции первого из них.