Храм был построен в период между 2012 и 2013 годами.
Город Неман, ранее известный как Рагнит, имеет богатую историю, уходящую корнями в XIII век. На месте нынешнего города в 1289 году была основана крепость Рагнит, которая впоследствии стала центром одноимённого города. После Второй мировой войны и вхождения территории в состав Советского Союза, город был переименован в Неман.
В послевоенный период в Немане, как и во многих других населённых пунктах Калининградской области, религиозная жизнь была ограничена, и храмы не функционировали. Однако с начала 1990-х годов, в условиях возрождения духовной жизни, началось восстановление и строительство новых храмов.
Строительство храма во имя святого Пантелеимона Целителя в Немане было осуществлено в начале второго десятилетия XXI века. Храм был возведён на новом месте и не является восстановлением ранее существовавшего здания. Архитектурный облик храма сочетает в себе традиционные элементы православного зодчества, включая купольную конструкцию и колокольню.
С момента открытия храм стал центром духовной жизни православных верующих города Неман и окрестностей. В нём регулярно проводятся богослужения, совершаются таинства и обряды, а также организуются мероприятия, направленные на духовное просвещение и поддержку прихожан.
