Храм Новомучеников и исповедников Церкви Русской в Ленинске-Кузнецком был основан в 1994 году. Здание храма ранее являлось складом бывшего ОРСа «Промтоваров», переданным администрацией города Русской Православной Церкви. Реконструкция здания включала надстройку стен, возведение колокольни и добавление необходимых пристроек. Летом 1994 года епископ Кемеровский и Новокузнецкий Софроний совершил молебен на основание храма.
Строительные работы продолжались два с половиной года, в них участвовали сестры монастыря и верующие горожане. Богослужения начали совершаться с 1996 года по большим церковным праздникам. В 1997 году настоятелем храма был назначен протоиерей Василий Гутович, при котором богослужения стали проводиться ежедневно. В 1998 году храм стал центром Ленинск-Кузнецкого благочиния.
К 2003 году внутреннее убранство храма было завершено: заполнен пятиярусный иконостас, закончена роспись стен. Верхняя часть храма была расписана кемеровскими мастерами-иконописцами, а завершающие работы выполнены украинскими специалистами. В 2000 году территория храма была благоустроена: заасфальтирована и ограждена.
При храме с 1998 года действует воскресная школа, получившая в 2002 году статус Церковно-Приходской. В школе организованы библиотека, музыкальный и театральный кружки, православный музей благочиния. С 1997 года при храме существует хор, участвующий в архиерейских богослужениях и епархиальных мероприятиях.
В 2015 году в библиотеке храма была организована выставка церковной утвари из разрушенных в годы гонений храмов Кузбасса. Экспозиция включала алтарные иконы, напрестольные кресты и другие сохранившиеся святыни.