Первоначально на этом месте находилась деревянная церковь, построенная в 1858 году.В 1873 году рядом с храмом была возведена деревянная колокольня со шпилем, крест которой был виден из города Боровичи.Внутреннее убранство храма включало иконы, написанные масляными красками, а также деревянную скульптуру преподобного Нила Столобенского, почти в натуральную величину, изготовленную в Нило-Столобенской пустыни.Скульптура отличалась минимальным использованием левкаса, что придавало ей особую выразительность.
В годы Великой Отечественной войны деревянная церковь была разобрана. Несмотря на отсутствие храма, место продолжало почитаться местными жителями, особенно в день памяти преподобного Нила.
В 2006 году церковь была восстановлена и освящена 26 августа архиепископом Новгородским и Старорусским Львом. Однако 17 июля 2008 года, во время сильной грозы, произошло возгорание, в результате которого храм сгорел.
4 июня 2016 года епископ Боровичский и Пестовский Ефрем совершил чин освящения вновь построенного храма во имя преподобного Нила Столобенского.
