Церковь Святителя Николая Чудотворца в селе Янтиково была построена на средства прихожан в 1902 году. До 1840 года село Янтиково было приписано к Ембулатовскому приходу, а с 1840 года — к приходу села Тойси. Храм строился усилиями местных жителей, что было характерно для практики церковного строительства в сельских районах Российской империи в конце XIX — начале XX века.
В 1894 году в соседнем селе Байглычево Тетюшского уезда Казанской губернии была построена и освящена новая деревянная церковь, что привело к упразднению старой церкви 15 июня того же года. Однако в 1901 году прихожане села Янтиково инициировали строительство нового храма на прежнем месте, который был освящен в 1902 году. Церковь была однопрестольной, деревянной, с отоплением. Ее длина вместе с колокольней составляла 12 саженей, а высота трехъярусной колокольни — 7,5 саженей. Храм венчали пять глав.
В 1940 году церковь была закрыта, а ее здание не сохранилось. Церковная община в селе Янтиково была вновь зарегистрирована в 1990 году. В 1992 году на месте прежнего храма была построена новая деревянная церковь, которую освятил архиепископ Чебоксарский и Чувашский. В 2006 году на историческом месте была возведена часовня в честь Святителя Николая.