В 1873 году по инициативе и на средства русского купца Тимофея Евграфовича Мокина в селе Усть-Кан была заложена деревянная церковь во имя святителя Николая Чудотворца. Строительство храма завершилось в 1875 году, и 16 июня того же года церковь была освящена начальником Алтайской духовной миссии архимандритом Владимиром (Петровым). Данный храм стал первым православным приходом в селе Усть-Кан и способствовал его дальнейшему развитию.
Архитектурно первая церковь представляла собой деревянное здание с одноименной колокольней, имеющее один престол во имя святителя Николая Чудотворца. Впоследствии, в начале XX века, в 1910-х годах, храм был перестроен и расширен, что позволило увеличить его вместимость и улучшить условия для проведения богослужений.
В советский период, характеризующийся антирелигиозной политикой государства, храм Николая Чудотворца в Усть-Кане был закрыт, а его здание использовалось для различных хозяйственных нужд. Точные даты закрытия и последующего разрушения храма не установлены, однако известно, что к концу XX века здание церкви было утрачено.
В период с 1970 по 1993 годы в селе Усть-Кан функционировала временная деревянная церковь Николая Чудотворца, расположенная по адресу улица Ленинская, 97. Данный храм служил местом проведения богослужений для местных прихожан до момента строительства нового храма.
В 1993 году началось строительство нового храма во имя святителя Николая Чудотворца на новом месте. Современный храм представляет собой деревянное здание, выполненное в традиционном русском стиле, с одним куполом и колокольней. Архитектурные особенности храма включают в себя элементы, характерные для сибирского зодчества, такие как бревенчатые стены и резные украшения.
В настоящее время храм Николая Чудотворца в селе Усть-Кан является действующим и открытым для посещения. Богослужения проводятся регулярно, а храм служит духовным центром для местных жителей и паломников. Адрес храма: Республика Алтай, Усть-Канский район, село Усть-Кан, Школьная улица, 1Г.