Село Бишкаин было основано в 1770 году переселенцами-чувашами из различных волостей Казанской губернии.
В середине XX века, в период антирелигиозной политики советского государства, первоначальный храм был разрушен в 1950-х годах. На его месте остались обломки белого гранита, которые в 2020 году послужили основой для создания памятника в честь утраченного храма.
К началу XXI века в селе возникла потребность в восстановлении православного храма. В результате был построен новый храм Николая Чудотворца, который, по данным на 2019 год, является действующим.