Храм Николая Чудотворца в посёлке Подюга Коношского района Архангельской области относится к числу исторических церковных сооружений Русского Севера. Первые упоминания о храмах в этом регионе восходят к XVII веку, когда территория входила в состав Вельского уезда Вологодской епархии. В клировых ведомостях за 1916 год зафиксированы церкви, находившиеся на территории современного Коношского района, включая Верхнеподюжскую волость.
В исторических документах сохранились сведения о Николаевской Вельцовской церкви, которая была приписана к Афанасиевской Верхнеподюжской церкви Вельского уезда. Этот храм, освящённый во имя святителя Николая Мирликийского, располагался на правом берегу реки Подюги. Здание церкви было деревянным, точная дата постройки неизвестна. В настоящее время населённый пункт Вельцы сохранился как деревня в Коношском районе.
Афанасиевская Верхнеподюжская церковь, к которой был приписан Николаевский храм, была построена в 1767 году. Она имела престол во имя святителей Афанасия и Кирилла Александрийских. Рядом с ней находилась вторая церковь - Николаевская Верхнеподюжская с колокольней, построенная в 1868 году. Оба храма располагались в деревне Николаевка, которая в настоящее время входит в состав Коношского района.
В исторических источниках упоминается также Спасопреображенская Хмельницкая церковь, находившаяся в Тавренгской волости Вельского уезда. Этот храм, построенный в 1818 году, имел престолы в честь Преображения Господня, святителя Модеста Иерусалимского и мучеников Флора и Лавра. Церковь располагалась в деревне Папинская севернее впадения реки Цыпины в Вель.
Церковная жизнь в Подюжском регионе развивалась в тесной связи с хозяйственной деятельностью местного населения. Источники свидетельствуют о наличии часовен в деревнях Хмельницкой волости, включая часовню в деревне Хмелевская, принадлежавшую Покровской Ширыхановской церкви. В приходских метриках сохранились записи о крещении, венчании и отпевании жителей окрестных деревень.
В XX веке многие храмы Вельского уезда, включая Подюжские, были закрыты. Часть церковных зданий была утрачена, другие использовались для хозяйственных нужд. В постсоветский период началось восстановление церковной жизни в регионе. Современный храм Николая Чудотворца в посёлке Подюга продолжает традиции православного богослужения в этом историческом регионе Русского Севера.
