Церковь Николая Чудотворца в Верхних Муллах представляет собой каменный однокупольный храм, выполненный в стиле классицизма. Первоначально сооружение включало трапезную и колокольню. Исторические данные указывают на наличие в трапезной двух приделов: Рождество-Богородицкого и Сергиевского. Храм был построен в 1844 году и функционировал как православный приход до 1931 года, когда был закрыт в рамках антирелигиозной политики советского государства.
В 1950-х годах трапезная и колокольня были демонтированы, что значительно изменило архитектурный облик здания. В 1996 году храм был возвращен Русской Православной Церкви, а с 2002 года начались работы по его реставрации. В ходе восстановительных мероприятий особое внимание уделяется воссозданию колокольни, утраченной в середине XX века.
Архитектурные особенности храма характерны для периода классицизма в церковном зодчестве. Однокупольная композиция, строгие пропорции и лаконичный декор соответствуют канонам данного стиля. Исторические источники не содержат подробных сведений о внутреннем убранстве храма до его закрытия, однако известно, что после передачи верующим началось постепенное восстановление иконостаса и настенных росписей.
В настоящее время храм продолжает функционировать как действующий православный приход. Богослужения совершаются согласно установленному расписанию. Архивные документы не содержат информации о значительных исторических событиях, связанных непосредственно с этим храмом, что характерно для многих провинциальных церквей Российской империи.