Согласно доступным источникам, храм был построен не позднее первой половины XVIII века, предположительно в 1725 году, на средства прихожан и при участии костромских мастеров.
Архитектурно здание церкви выполнено в переходном стиле между барочной традицией и классицизмом. В трапезной части храма располагались два придела: во имя Ярославских Чудотворцев и в честь Боголюбской иконы Божией Матери. Здание окружено старинным кладбищем, на котором находятся захоронения известных купеческих фамилий Понизовкиных и Трутневых.
В советский период, когда многие религиозные учреждения подвергались закрытию, церковь Николая Чудотворца в деревне Бор продолжала функционировать и не прекращала своей деятельности.
В 2022 году ансамбль церкви Николая Чудотворца, включая храм, юго-западные, северо-западные и святые ворота, был включен в Единый государственный реестр объектов культурного наследия в качестве памятников местного значения. Это решение открыло возможности для проведения ремонтно-реставрационных работ под контролем специалистов и с участием лицензированных организаций.
