Храм во имя святой блаженной Ксении Петербургской в Ростове-на-Дону был основан как приход в 2012 году. Регистрация местной религиозной организации состоялась 11 октября 2012 года. Приход относится к Ростовской-на-Дону епархии Русской Православной Церкви (Московский Патриархат).
Здание храма находится в стадии строительства. Первоначально приход функционировал без постоянного храмового здания, проводя богослужения во временных помещениях. Участок под строительство был выделен на проспекте Шолохова. Архитектурный проект соответствует традициям русского церковного зодчества с элементами византийского стиля.
Сестричество во имя святой блаженной Ксении Петербургской при Свято-Казанском приходе Ростова-на-Дону было образовано ранее, в 2005 году. Деятельность сестричества включала социальное служение, помощь больным и нуждающимся. Это свидетельствует о наличии почитания святой Ксении в регионе до основания отдельного храма.
Святая блаженная Ксения Петербургская, в честь которой освящен храм, жила в XVIII веке в Санкт-Петербурге. После внезапной кончины супруга, придворного певчего Андрея Федоровича Петрова, она избрала путь юродства. Канонизирована Русской Православной Церковью в 1988 году. Мощи святой находятся в часовне на Смоленском кладбище Санкт-Петербурга.
В 2015 году приход получил нового настоятеля. Финансовые отчеты организации показывают ограниченную хозяйственную активность, что характерно для строящихся храмов. Выручка прихода незначительна, что указывает на зависимость от пожертвований.