Храм Коневской иконы Божией Матери в поселке Саперное был основан в 1994 году по благословению митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Иоанна (Снычева). Строительство началось в сентябре 1994 года, а первое освящение воды состоялось 10 января 1995 года у стен возводимого храма. Проект здания разработан архитектором Н. С. Веселовым в традициях северного деревянного зодчества.
22 июня 1995 года храм был освящен малым чином в честь Коневской иконы Божией Матери, почитаемой как покровительница Карельской земли. Чин освящения совершили представители духовенства, включая наместника Коневского монастыря и братию Валаамской и Коневской обителей. В 1996 году в храме замироточила аналойная икона Коневской Божией Матери, что было зафиксировано в церковных записях.
С 1996 года при храме действует духовная лечебница для реабилитации наркозависимых, ставшая первым епархиальным центром подобного профиля в России. В 1997–2001 годах проведена реконструкция храма: возведены прирубы, увеличен алтарь, построен нижний храм в честь преподобного Сергия Радонежского. Комплекс окончательно сформировался к 2011 году.
Храм относится к Выборгской епархии Русской Православной Церкви. На территории подворья расположены хозяйственные постройки, ферма и огород, используемые в программе социальной адаптации.
