Храм Иверской иконы Божией Матери в Новоалтайске был основан в конце 1990-х годов. Первоначально богослужения проводились в приспособленном здании бывшего детского сада. Строительство нового кирпичного храма началось в 2008 году и завершилось в 2012 году. Освящение храма состоялось 21 октября 2012 года.
Архитектурный проект храма был разработан в мастерской П.И. Анисифорова архитекторами Е.А. Назаровой и Е.Г. Фёдоровой. Здание выполнено в традиционном православном стиле с шатровым куполом и шатровой колокольней. Высота центральной части пятикупольного храма составляет 26 метров.
Храм имеет два придела: верхний освящён в честь Иверской иконы Божией Матери, нижний - в честь святых апостолов Петра и Павла. Иконостас храма украшен иконами греческого письма, привезёнными со Святой Горы Афон. В греческом стиле выполнена также люстра центрального купола.
24 августа 2012 года на звонницу храма были установлены десять колоколов, отлитых ярославскими мастерами. Храм унаследовал историческое название от старообрядческой церкви, существовавшей на этом месте более 100 лет назад и трижды разрушавшейся в XX веке.
Первая часовня на территории современного Белоярска была построена ещё в XIX веке на территории крепости. После 1955 года храмовых сооружений на этом месте не существовало до конца 1990-х годов, когда была создана православная община.