Деревня Лудони, находящаяся в северо-западной части Псковской области, в советский период не имела собственного православного храма. В начале 2000-х годов, в условиях возрождения религиозной жизни в России, местные жители выразили инициативу о строительстве храма для обеспечения духовного окормления населения. Выбор небесного покровителя пал на святого праведного Иоанна Кронштадтского, канонизированного в 1990 году и почитаемого за его пастырскую деятельность и благотворительность.
Строительство храма началось в 2005 году на средства, собранные от пожертвований прихожан и благотворителей. Архитектурный проект предусматривал возведение деревянного здания в традиционном русском стиле с элементами древнерусского зодчества. Здание представляет собой одноэтажный храм с центральным куполом и небольшой колокольней, примыкающей с западной стороны. Фасады украшены декоративными элементами, характерными для православных храмов. Внутреннее убранство включает иконостас и росписи, выполненные в соответствии с канонами православного искусства.
В 2010 году основные строительные работы были завершены, и храм начал функционировать в новом здании. В этом же году состоялось освящение храма во имя святого праведного Иоанна Кронштадтского. С момента открытия храм стал центром духовной жизни деревни Лудони и окрестных населённых пунктов. При храме организованы воскресная школа для детей и различные просветительские мероприятия. Регулярно проводятся богослужения и церковные таинства.