Храм Иоанна Богослова в деревне Новгородово Вологодской области был основан в 2014 году как объект восстановления силами благотворительного фонда. Благотворительный фонд «Восстановление храма Иоанна Богослова в деревне Новгородово» был зарегистрирован 17 июня 2014 года в Вологде. Целью фонда являлось возрождение церковного здания, исторические данные о котором отсутствуют в открытых источниках.
Сведений о существовании храма на данном месте до XXI века не обнаружено. В 2014 году начались работы по восстановлению, финансируемые за счет пожертвований. Архитектурные особенности здания соответствуют традициям северного деревянного зодчества. В плане храм представляет собой четверик с прирубленным алтарем и трапезной частью. Кровля выполнена в форме шатра, увенчанного главкой с крестом.
В 2020-х годах храм перешел под управление Русской Православной Церкви. Богослужения совершаются по полному кругу, включая воскресные и праздничные службы. В интерьере сохраняются традиционные элементы: иконостас с царскими вратами, клиросы и аналои. Настенные росписи выполнены в канонической манере вологодской иконописной школы.
При храме действует воскресная школа для детей прихожан. Занятия проводятся по субботам и включают изучение Закона Божия и церковнославянского языка. Библиотека храма насчитывает около 200 изданий, преимущественно богослужебной литературы и творений святых отцов. Хозяйственная инфраструктура включает свечной ящик и церковную лавку.