Храм иконы Божией Матери «Взыскание погибших» на Зацепе был основан в 1904 году как домовая церковь при Женском коммерческом училище Московского общества распространения коммерческого образования. Строительство осуществлено по проекту архитектора Николая Львовича Шевякова в стиле эклектики с элементами неорусского стиля и модерна. Финансирование работ обеспечил купец Павел Григорьевич Котов, пожертвовавший 90 000 рублей из 150 000 общих вложений. Освящение храма состоялось 9 июня 1905 года.
Архитектурный комплекс включал двухэтажный корпус для подготовительных классов (1910-1911 гг., архитектор Александр Зеленко). Храм вмещал до 300 человек, а с раздвижной перегородкой — до 800. Интерьер отличался двухъярусным мраморным иконостасом работы В.П. Акимова, мозаичными полами и керамической облицовкой стен. Главной святыней стала икона Божией Матери «Взыскание погибших» в серебряной ризе с бриллиантами, подаренная П.Г. Котовым в 1903 году.
После 1918 года храм функционировал как приходской, а в 1929 году был передан Московскому плановому институту. В советский период внутреннее убранство утрачено, пространство разделено перегородками. В 2002 году зарегистрирован приход, а с 2011 года возобновлены богослужения в алтарной части. Полная реставрация завершена 30 августа 2016 года, 14 октября того же года состоялось Великое освящение храма Патриархом Кириллом.
Престольный праздник — 18 февраля (5 февраля по юлианскому календарю). Иконография образа восходит к апокрифическому сказанию VI века о покаянии эконома Феофила. В начале XX века в Москве насчитывалось лишь пять храмов с главным престолом в честь этой иконы, три из которых находились при медицинских и пенитенциарных учреждениях.