Храм иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» в Ессентуках был возведён в память о жертвах теракта, произошедшего 5 декабря 2003 года в электропоезде «Кисловодск – Минеральные Воды». Взрывное устройство сработало в утренний час пик, когда состав перевозил преимущественно студентов, направлявшихся на учёбу в города Кавказских Минеральных Вод. В результате инцидента погиб 41 человек, более 300 получили ранения. Среди погибших был диакон Никольского собора Кисловодска.
Инициатива строительства храма-памятника принадлежала родственникам погибших и пострадавших. Участок под строительство был выделен на территории Ессентукской городской больницы, куда доставляли раненых после теракта. Первоначально богослужения совершались во временном храме, оборудованном в переоборудованном железнодорожном вагоне. Этот временный храм функционировал в течение всего периода строительства основного здания.
Закладка постоянного храма состоялась 17 декабря 2011 года, в день памяти святой великомученицы Варвары. Чин основания совершил благочинный Кисловодского округа. Строительство велось на пожертвования прихожан и благотворителей. Храм был построен в традиционном русском деревянном зодчестве по типу «восьмерик на четверике» с шатровым завершением и трёхъярусной колокольней.
29 марта 2014 года для храма были доставлены колокола, отлитые по древней технологии в городе Тутаев Ярославской области. Великое освящение храма совершил 17 ноября 2013 года архиерей Пятигорской и Черкесской епархии. На стене храма установлена мемориальная доска в память о трагических событиях 2003 года.
При храме действует сестричество милосердия, оказывающее помощь больным в городской больнице. Также организована социальная служба, включающая благотворительную столовую и летний лагерь для детей. Храм является памятником жертвам теракта и центром духовной жизни для пациентов больницы и жителей города.