Архитектурно храм представлял собой деревянное здание, характерное для северного зодчества. В 2007 году для храма были изготовлены колокола в городе Воронеже, приобретённые на средства, пожертвованные жителями Верхней Тоймы. Храм стал центром духовной жизни села, в нём регулярно проводились богослужения и церковные обряды.
24 января 2015 года храм был полностью уничтожен пожаром. В результате пожара были утрачены почти вся церковная утварь, включая особо чтимую икону Сергия Малопинежского, а также звонница с колоколами. Причины возгорания не уточняются в доступных источниках.