В начале 1990-х годов, в условиях отсутствия действующего православного храма в Лабытнанги, местная церковная община инициировала обустройство временного храма в здании бывшего клуба лесобазы. Первоначально вместо колоколов использовались обрезки кислородных баллонов различной длины. В 1996 году была установлена звонница из девяти настоящих колоколов, отлитых на одном из заводов города Каменск-Уральский. С 1996 года при храме были открыты три воскресные школы: одна для взрослых, другая для детей, а также школа при часовне во имя святой великомученицы Анастасии Узорешительницы при исправительном учреждении №8.
12 сентября 1998 года, по благословению епископа Тобольского и Тюменского Димитрия, состоялось освящение закладного камня на месте будущего каменного храма. Строительство нового храма продолжалось девять лет и завершилось в 2007 году. 13 октября 2007 года новый каменный храм в честь великомученика Георгия Победоносца открыл свои двери для прихожан.
Архитектурно новый храм представляет собой каменное здание с элементами традиционного православного зодчества. После постройки нового храма, старое деревянное здание было переоборудовано под приходскую школу.