Строительство храма было обусловлено потребностью местного православного сообщества в месте для богослужений и духовного окормления.
Точные даты начала и завершения строительства храма, а также имена его основателей, в доступных источниках не указаны. Известно, что храм расположен на станичном кладбище. Архитектурные особенности здания не описаны в доступных источниках.
Станица Зеленчукская является центром благочиния Южного Карачаево-Черкесского церковного округа Пятигорской и Черкесской епархии, созданного 20 октября 2011 года. В станице также находится храм святых первоверховных апостолов Петра и Павла, являющийся главным храмом благочиннического округа. Церковь святого великомученика Феодора Тирона функционирует как приходской храм, обеспечивая духовное окормление местных жителей.
В церковном календаре отмечается память святого великомученика Феодора Тирона, в честь которого назван храм. Святой Феодор Тирон был воином в городе Аласии Понтийской области в Малой Азии и прославился своим мученическим подвигом за христианскую веру. В день его памяти в храме проводятся богослужения, посвященные святому.