Храм во имя святого великомученика Феодора Стратилата в станице Глазуновской был возведен в конце XVIII века. Первое упоминание о церковном строении на этом месте относится к 1759 году, когда в станице существовала деревянная церковь во имя святителя Николая Чудотворца. В 1790 году этот храм сгорел во время пожара, после чего станица была перенесена на новое место.
14 мая 1794 года жители станицы заложили каменную церковь во имя Воздвижения Креста Господня с приделом святителя Николая Чудотворца. Главный престол был освящен 1 сентября 1800 года. В приход храма входили хутора Мокрый, Чигонацкий, Суходольский и Чеплыжный. При церкви действовали приходское училище и школа грамоты.
В советский период храм был закрыт, точная дата закрытия неизвестна, но к 1934 году здание уже не использовалось для богослужений. В годы гонений на Церковь пострадали служившие в храме священнослужители. Во время Великой Отечественной войны здание, по-видимому, не претерпело значительных разрушений.
В послевоенные годы храм не возвращался верующим, несмотря на попытки местных жителей в 1955 году добиться его открытия. В конце XX века началось возрождение церковной жизни в станице. В настоящее время в Глазуновской действует храм, освященный во имя святого великомученика Феодора Стратилата.
Архитектурные особенности первоначального каменного храма включали четырехъярусную колокольню с восьмигранным куполом, построенную в 1804 году. До этого при церкви существовала простая деревянная звонница. В XVIII-XIX веках храм пополнялся церковной утварью и святынями, часть которых в 1930-е годы была изъята и передана для продажи за границу.
