Храм в честь Царственных мучеников в селе Варениковском был основан в начале XXI века. Инициатива его строительства исходила от местной православной общины, желавшей увековечить память о семье последнего российского императора Николая II. Земля под строительство была выделена в 2003 году, а освящение закладного камня состоялось в 2005 году.
Архитектурное решение храма выполнено в традициях русско-византийского стиля, характерного для церковного зодчества конца XIX – начала XX века. Основной объем представляет собой четверик, увенчанный луковичным куполом. Фасады украшены килевидными закомарами и декоративными кокошниками. Колокольня возведена в три яруса.
Строительство велось на пожертвования прихожан и благотворителей. В 2008 году были завершены основные работы, и храм был освящен архиерейским чином. Иконостас выполнен мастерами Палеха в канонической традиции. Особое место в храме занимает икона Царственных страстотерпцев с частицей мощей.
В 2010-х годах при храме была организована воскресная школа и библиотека духовной литературы. Богослужения совершаются регулярно согласно уставу. Храм является частью благочиния Ставропольской и Невинномысской епархии Русской Православной Церкви.
Исторически местность, где расположен храм, входила в состав Кубанской области. В дореволюционный период здесь находился молитвенный дом, закрытый в 1930-х годах. Таким образом, строительство нового храма восстановило прерванную традицию православной жизни в селе.