Посёлок Ключи был основан в начале XX века в рамках переселенческой политики Российской империи, направленной на освоение сибирских территорий. С момента основания жители посёлка стремились к созданию духовного центра, что выразилось в инициативе строительства православного храма. В 1910 году началось возведение деревянной церкви во имя Богоявления Господня. Строительство было завершено в 1912 году, и храм стал центром религиозной жизни для местных жителей.
Архитектурно храм представлял собой деревянное здание, характерное для сибирского зодчества того периода. Он имел один купол и колокольню, соединённую с основным зданием. Внутреннее убранство было скромным, но соответствовало канонам православной церкви.
В 1930-х годах, в период антирелигиозной кампании, храм был закрыт, а его здание использовалось для различных хозяйственных нужд. В результате этого периода храм пришёл в упадок, и его архитектурный облик был значительно утрачен.
В 1990-х годах, с началом процесса возрождения религиозной жизни в России, в посёлке Ключи была зарегистрирована православная община, которая поставила своей целью восстановление храма. Благодаря усилиям местных жителей и поддержке епархии было принято решение о строительстве нового храма на месте утраченного. Строительство началось в начале 2000-х годов и завершилось в 2010 году.
Новый храм был построен из кирпича, что обеспечило его долговечность и соответствие современным строительным нормам. Архитектурный стиль здания сочетает традиционные элементы православного храмового зодчества с современными решениями. Храм имеет один купол и колокольню, что подчёркивает его принадлежность к русской православной архитектурной традиции.