Село Ковалёво исторически являлось центром Ковалёвской волости и находилось во владении Московских митрополитов. В середине XIX века село, вместе с прилегающими деревнями, перешло к А.П. Монасееву, служившему в Нерехтском уездном суде.
В 1778 году, на средства прихожан, в селе была построена каменная церковь, освящённая в честь Богоявления Господня. Помимо основного престола, в храме был устроен придел во имя святителя Николая Чудотворца. Церковь была обнесена деревянной оградой, внутри которой располагалось приходское кладбище.
Архитектурно храм представляет собой двусветный четверик, завершённый высокой четырёхскатной кровлей и увенчанный луковичной чешуйчатой главкой на цилиндрическом барабане. С восточной стороны к нему примыкает невысокая, слегка зауженная полуциркульная апсида, а с западной — трапезная, по высоте уравненная с алтарём. Трёхъярусная колокольня, состоящая из четвериков, почти равных по площади, завершена гуськовой кровлей, над которой вознесён высокий шпиль на четырёхгранном барабане.
В начале XX века к колокольне с южной стороны была пристроена небольшая палатка. Предположительно, в этот же период церковная территория, включавшая приходское кладбище, была обнесена кирпичной оградой, которая к настоящему времени утрачена. На кладбище у церкви сохранилось несколько надгробий начала XX века с металлическими крестами на кубообразных кирпичных постаментах.
Внутреннее убранство храма включало настенную живопись третьей четверти XIX века. На северной и южной сторонах западной стены были изображены фигуры святых в клеймах арочной формы, а в откосах окон второго света — избранные святые. В перемычках оконных проёмов, очерченных тянутыми рамами, на облачных фонах были написаны херувимы.
