Храм в честь Богоявления Господня в городе Новый Уренгой был заложен в 2007 году по благословению архиепископа Тобольского и Тюменского Димитрия. Решение о строительстве нового храма было принято в связи с тем, что ранее существовавший храм преподобного Серафима Саровского, возведённый в 1998 году, перестал вмещать всех прихожан, особенно в дни великих церковных праздников.
13 октября 2007 года состоялось освящение места под строительство храмового комплекса. В марте 2008 года была освящена первая свая, что ознаменовало начало строительных работ. Финансирование осуществлялось за счёт пожертвований прихожан, предприятий и организаций города, включая градообразующие компании ООО «Газпром добыча Уренгой» и ООО «Газпром добыча Ямбург». Всего было проведено семь благотворительных марафонов, в ходе которых собрано около 300 миллионов рублей.
В мае 2010 года на строительную площадку прибыла бригада строителей, и к августу здание храма приобрело характерные очертания. Храм возводился в традиционной крестообразной форме, символизирующей Крест Христов как основу Церкви. В марте 2011 года на колокольню установили комплект из девяти колоколов, отлитых в Челябинской области. Вес колоколов варьировался от 6 до 1200 килограммов.
В феврале 2012 года состоялось освящение и установка куполов, увенчанных православными крестами. Высота храма составила 36 метров, что сделало его самым высоким зданием в южной части города. В сентябре 2014 года был смонтирован иконостас, изготовленный в стиле древнерусской резьбы с использованием сусального золота. Иконостас создан мастерами из подмосковного Хотькова и рассчитан на длительную эксплуатацию.
28 декабря 2014 года строительство храмового комплекса было завершено, и храм стал действующим. 15 сентября 2015 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл совершил чин великого освящения Богоявленского собора. Храм рассчитан на 650 человек и имеет двухуровневое пространство. На территории комплекса также располагается православная гимназия, открытая в сентябре 2014 года.