Храм святого благоверного великого князя Александра Невского в Бизерте был возведен в 1938 году как памятник кораблям Русской эскадры, прибывшим в Тунис в 1920 году. В декабре 1920 года в порт Бизерта пришли 33 корабля Российского Императорского флота с экипажами и беженцами, покинувшими Крым после поражения Белого движения. Общее число прибывших составило около 6000 человек, включая 13 православных священников.
Первые богослужения для русской общины совершались на палубе линейного корабля «Георгий Победоносец», где была оборудована временная церковь. В 1924 году, после признания Францией Советской России, корабли эскадры были переданы французским властям. К 1925 году численность русской колонии в Тунисе сократилась до 700 человек, а корабельная церковь была перенесена в арендованное помещение на улице Апри.
Строительство каменного храма началось в 1937 году по проекту военного инженера Н.С. Сухаржевского. Земельный участок был приобретен Ассоциацией православных Бизерты. Храм возводился в неорусском стиле с элементами архитектуры XVII века. Освящение состоялось 10 сентября 1938 года. В оформлении интерьера использованы элементы с кораблей эскадры, включая якоря, люстры и мраморные плиты с линкора «Генерал Алексеев».
В годы Второй мировой войны храм получил повреждения от бомбардировок и был восстановлен в послевоенный период. После обретения Тунисом независимости в 1956 году русская община значительно сократилась. С 1962 по 1992 год храм окормлялся священниками Александрийского патриархата. В феврале 1992 года приход был принят в юрисдикцию Московского патриархата.
В храме сохраняются реликвии Русской эскадры: Андреевский флаг с «Георгия Победоносца», использованный в качестве завесы Царских врат, иконы Христа Спасителя, Божией Матери, святых Константина и Елены, а также мраморная доска с названиями всех кораблей, прибывших в Бизерту. С 29 декабря 2021 года храм относится к Северо-Африканской епархии Русской православной церкви.