Община прихода была зарегистрирована в декабре 2007 года. В 2009 году в рамках совместного проекта Церкви и государства «200 храмов в Москве» был утвержден план строительства храма блаженной Матроны Московской. В 2011–2012 годах, после согласований, постановлением Правительства Москвы был утвержден проект планировки части территории «Парк на Ангарской» и выделен земельный участок по адресу: улица Софьи Ковалевской, напротив владения 14, под строительство храмового комплекса.
В марте–апреле 2013 года было начато и завершено строительство временного храма, который был освящен 28 апреля 2013 года, в день Входа Господня в Иерусалим. В этом храме была отслужена первая Божественная литургия. 26 октября 2013 года во временном храме состоялось первое архиерейское богослужение.
В ноябре–декабре 2013 года начались работы по строительству основного храма: был вырыт котлован и проведены работы по гидроизоляции. В феврале 2014 года была залита бетонная плита основания храма. 27 августа 2014 года после Божественной литургии прошло торжественное освящение основания и закладного камня храма.
К январю 2015 года было завершено строительство нижнего храма в честь праведного Иоанна Кронштадтского. 29 августа 2015 года состоялось торжественное освящение крестов и куполов храма. 7 сентября 2015 года была произведена установка главного купола храма. 14 апреля 2016 года были освящены колокола для звонницы, отлитые на заводе ЛИТЭКС. 28 апреля 2016 года в нижнем храме прошла первая служба.
Архитектурно храм представляет собой пятикупольное здание с тремя алтарными апсидами, рассчитанное на 500 человек. Во внешнем облике храма доминируют элементы владимиро-суздальской школы церковного зодчества. Здание храма прямоугольное в плане с ярко выраженными входными группами, четырехстолпное. В подвальной части храма предусмотрены ризница, подсобные помещения, вентиляционная камера и электрощитовая. Отдельно установлена трёхглавая звонница ростовского типа.
В настоящее время храм благоустроен. На приходе ведется духовно-просветительская деятельность, работает социальная служба, молодежный клуб, воскресная школа для детей и взрослых, творческая мастерская, детская хоровая студия. Храм духовно окормляет Центр профессиональной подготовки при Главном управлении МВД России по городу Москве.
