В 1876 году на улице Зальпе была возведена первая православная церковь, ставшая духовным центром для местных жителей.В середине 1880-х годов игумен Платон предпринял попытку создания мужской обители при Шкотовском храме, однако эта инициатива не увенчалась успехом.
К началу XX века на улице Зальпе возвышался просторный деревянный храм, способный вместить около 300 прихожан во время воскресных богослужений. При храме функционировала церковно-приходская школа, а также флигель с крестильней и гостевыми комнатами для прихожан.
В период советской власти храм был закрыт, а настоятель Пантелеимон Червонный подвергся репрессиям и был расстрелян. Не позднее 1935 года церковь была сожжена.
В конце XX – начале XXI века в Шкотово возродилась православная община. В 2002 году для богослужений было получено помещение, приспособленное под храм. В 2003 году началась проектировка нового православного храма на историческом месте. Первоначально планировалось возведение вместительного каменного храма, однако из-за недостатка средств было решено построить небольшую деревянную часовню. 23 сентября 2005 года архиепископ Владивостокский Вениамин (Пушкарь) совершил чин освящения закладки храма, после чего началось строительство.
Строительство храма осуществлялось на средства прихожан и благотворителей Шкотовского района. К 2006 году храм был построен и в нём начались регулярные богослужения. Здание представляет собой небольшой двухкупольный храм из бруса с вместимостью около 100 человек. Внутри оборудован пол с подогревом для комфорта прихожан.
В храме хранится частица мощей блаженной Матроны Московской, переданная из Покровского ставропигиального монастыря.