Первоначально на этом месте находилась деревянная церковь, построенная в XVIII веке. В 1824 году, после разрушительного пожара, уничтожившего предыдущий храм, была возведена новая деревянная церковь на территории бывшего подворья Петропавловского монастыря. Однако и этот храм был уничтожен пожаром, вместе с которым сгорел весь церковный архив, что затруднило восстановление полной истории прихода. Известно, что храм стоял на берегу реки Десны, где впоследствии был установлен каменный столб в память о нем.
В период с 1896 по 1900 годы на месте сгоревшего деревянного храма был построен новый каменный трехпрестольный храм в честь Благовещения Пресвятой Богородицы. Храм имел два придела: во имя святителя Николая Чудотворца и в честь Покрова Пресвятой Богородицы. В 1898 году был освящен левый придел, а в 1899 году — правый. Главный алтарь был украшен новым иконостасом, установленным в 1900 году. Архитектурно здание представляло собой сложное в плане одноэтажное сооружение, обложенное кирпичом, с невысоким шатром и луковичной главой на тонком барабане. Отдельно стояла четырехъярусная колокольня. Храм занимал господствующее положение на высоком берегу реки, что придавало ему особую выразительность в ландшафте.
В начале 1930-х годов храм был закрыт и использовался для различных хозяйственных нужд: в его стенах размещались парикмахерская, склад типографской бумаги, типография и гараж. В апреле 1971 года здание церкви было окончательно разрушено и разобрано на строительные материалы.
Новая история Благовещенского храма началась в 2009 году, когда на месте прежнего храма было решено создать часовню-памятник. Строительство центральной части часовни было осуществлено трудами прихода храма в честь Преображения Господня (Спасо-Гробовского) и при поддержке генерального директора ООО «Промстрой». Впоследствии строительство было приостановлено. Позже было принято решение реконструировать часовню в полноценный храм, что было обусловлено необходимостью совершения литургий и отсутствием других православных храмов в шаговой доступности для местных жителей.