Первый храм в честь святого Архистратига Михаила был построен в селе Усть-Тарка в 1857 году. Это была деревянная однопрестольная церковь, обслуживавшая прихожан из села Усть-Тарка и близлежащих деревень Тамбовка и Щербаки. Общее число прихожан составляло 3184 человека, включая 189 раскольников. При храме имелись пахотные и сенокосные земли площадью 99 десятин. Штат причта состоял из священника и псаломщика, которые получали жалование от казны и имели дополнительные доходы от треб. В 1893 году в деревне Щербаки была открыта церковная школа грамоты, а в селе Усть-Тарка функционировало училище гражданского ведомства. В том же году было создано церковно-приходское попечительство.
В 1930-х годах, в период антирелигиозной политики советской власти, храм был полностью уничтожен. На протяжении нескольких десятилетий в селе отсутствовало действующее православное храмовое здание.
В январе 2009 года, по инициативе местных жителей и с благословения архиепископа Новосибирского и Бердского Тихона, была организована православная община в честь новомучеников и исповедников Российских. Администрация Усть-Таркского района предоставила общине помещение для проведения богослужений и отправления религиозных обрядов. В августе 2010 года в новообразованную общину был назначен настоятель, после чего богослужения и таинства стали совершаться регулярно.
С августа по октябрь 2011 года было заложено основание для нового храма. 23 апреля 2012 года началось возведение стен здания. Строительство продолжалось до 2014 года, когда храм был завершен и освящен в честь Архангела Михаила. Современный храм представляет собой каменное здание с архитектурными особенностями, характерными для православных церквей.
