Каменный храм во имя Архангела Михаила в селе Шапкино Борисоглебского уезда был освящён в 1912 году. Архитектурный облик здания соответствует традициям православного храмового зодчества начала XX века. Сведений о более ранних церковных постройках на данном месте в доступных источниках не обнаружено.
В период гонений на религию в советские годы храм, как и большинство культовых сооружений, был закрыт. Точная дата закрытия в документальных источниках не зафиксирована. Здание использовалось для хозяйственных нужд, что привело к утрате элементов внутреннего убранства и частичному разрушению конструкций.
Возрождение церковной жизни началось в конце XX века. Храм был возвращён Русской Православной Церкви и постепенно восстановлен. Реставрационные работы проводились с сохранением первоначальных архитектурных форм. В настоящее время в храме регулярно совершаются богослужения по православному чину.
Архивные документы свидетельствуют, что приходская жизнь в селе Шапкино имеет давние традиции. В метрических книгах XIX века сохранились записи о совершавшихся здесь таинствах крещения и венчания. Особенностью местного прихода было наличие смешанного русско-татарского населения, что отражалось в церковной документации.
Иконостас храма выполнен в традициях церковного искусства Поволжского региона. Часть икон датируется началом XX века, другие были написаны в период возрождения храма. В архитектурном плане здание представляет собой однокупольный храм с колокольней, характерный для сельских приходов данного региона.