Храм в честь святого апостола Андрея Первозванного в Зеленоградске был возведён в 1903–1904 годах как католическая капелла в неоготическом стиле. Проект здания разработал плотник Лауфер из Кёнигсберга. Первоначально сооружение имело размеры 9×12 метров и было украшено фресками. Освящение капеллы состоялось в честь святого Андрея, а богослужения проводились священниками из Кёнигсберга: летом — дважды в месяц, зимой — ежемесячно. В 1936 году католическая община Кранца получила собственного пастора — Антона Пошмане.
В довоенный период капелла находилась рядом с домом отдыха «Серые сёстры», принадлежавшим госпиталю Святой Елизаветы. Позднее здание было приобретено для организации детского отдыха. В советское время капелла использовалась как склад, пережила два пожара, в результате которых были утрачены внутренние росписи. Впоследствии здание было перестроено в соответствии с православными канонами.
В 1989 году здание передано Русской Православной Церкви. 14 января 1991 года состоялось освящение храма в честь апостола Андрея Первозванного, которое совершил митрополит Смоленский и Калининградский Кирилл. В 2007 году постановлением Правительства Калининградской области бывшая капелла получила статус объекта культурного наследия местного значения. В 2014 году епископом Балтийским Серафимом освящена колокольня храма. В 2023 году на территории храма установлен памятник апостолу Андрею.
В храме находятся частицы мощей святых, включая апостола Андрея Первозванного, святителя Николая Чудотворца, равноапостольной Марии Магдалины, великомученика Пантелеимона и преподобного Нила Столобенского. При храме действует воскресная школа и библиотека.