Точные сведения о дате её строительства и архитектурных особенностях в доступных источниках отсутствуют.
История православных храмов в станице Новотроицкой уходит в XIX век. В 1832 году жители станицы были приняты в казаки, и незадолго до революции были построены ещё два храма – в честь святого Николая Чудотворца и в честь Трёх Святителей: Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста.
В настоящее время в станице действует церковь во имя святителя Николая Чудотворца, построенная в период с 2001 по 2010 год. Она является действующим храмом Ставропольской и Невинномысской епархии Русской Православной Церкви.