Основание монастыря связано с деятельностью Марии Васильевой, которая в 1869 году построила деревянную Покровскую церковь. На основе этой церкви 24 ноября 1874 года была учреждена женская община, получившая в 1885 году статус монастыря под названием Покровский Чагринский. Первой настоятельницей стала монахиня Серафима (в миру Софья Константиновна Васильева), выпускница Петербургского патриотического института, ранее служившая в различных монастырях.
Монастырь стал известен благодаря служению священника Александра Юнгерова, впоследствии причисленного к лику святых. Он был направлен в обитель в 1880 году и прославился как обладатель дара прозорливости и чудотворений. Его проповеди и духовные наставления привлекали в монастырь множество паломников со всей России. В 1890 году, при его участии, была построена теплая церковь во имя святого Архангела Михаила. В 1901 году началось строительство нового трехпрестольного храма во имя Покрова Пресвятой Богородицы, завершенное в 1907 году. Храм имел приделы во имя святителя Николая Чудотворца и Казанской иконы Божией Матери.
Монастырь обладал значительным земельным наделом, включая 1419 десятин, пожертвованных купцом Головачевым, и еще 500 десятин, полученных по завещанию в 1890 году. На территории обители находились жилые корпуса, хозяйственные постройки, фруктовый сад, пчельник, мельницы и другие сооружения. В Самаре монастырь имел подворье с необходимыми хозяйственными постройками.
После установления советской власти монастырь был закрыт в 1928 году. Его здания были переданы различным учреждениям: Покровская церковь стала школой крестьянской молодежи, церковь Архангела Михаила — избой-читальней, монастырские корпуса использовались сельскохозяйственными предприятиями. Архитектурный комплекс монастыря был в основном уничтожен в 1930-е годы, а Покровская церковь разрушена в 1949 году из-за ветхости.
В 2016 году началось восстановление монастыря по благословению епископа Кинельского и Безенчукского Софрония. На территории бывшей обители был построен малый Покровский храм на фундаменте утраченного, установлены поминальные часовни над могилами Александра Чагринского и игуменьи Серафимы, а также начато строительство большого храма в честь святого праведного Александра Чагринского. В 2023 году Священный Синод Русской Православной Церкви постановил открыть Покровский Александро-Чагринский женский монастырь и назначить игуменью.
