Храм во имя святителя Алексия, митрополита Московского, в селе Середниково был основан в 1693 году по храмозданной грамоте Святейшего Патриарха Всея Руси Адриана. Челобитье на строительство каменной двухэтажной церкви подавал стольник князь Иван Михайлович Егупов-Черкасский, владевший селом с 1686 года. Первоначальный храм имел нижний тёплый престол во имя святителя Алексия и верхний холодный в честь Нерукотворного Образа Спасителя.
В 1777-1782 годах при новом владельце усадьбы статском советнике Всеволоде Алексеевиче Всеволожском церковь была капитально перестроена в стиле классицизма. Первоначальная колокольня была разобрана, вместо неё сооружена звонница. В этот период храм стал духовным центром округи, к нему были приписаны прихожане упразднённых церквей сел Подолино и Благовещенка.
В 1814-1823 годах при графе Григории Алексеевиче Салтыкове в трапезной части храма был устроен тёплый придел во имя великомученицы Параскевы. В 1865 году на средства новых владельцев усадьбы Фирсановых была возведена трёхъярусная колокольня. В 1890-1892 годах трапезная расширена приделами Смоленской иконы Божией Матери и великомученицы Параскевы.
Храм не закрывался в советский период, оставаясь единственным действующим в Солнечногорском районе. В 1941 году колокольня была разрушена в ходе оборонительных мероприятий на подступах к Москве. Богослужения не прекращались. В 2000 году колокольня восстановлена на средства прихожан. Сохранился главный иконостас 1780-х годов, часть храмовых икон датируется концом XIX века.